长江大学心理咨询中心成立于2003年合校之初。2005年，咨询中心获评“湖北省优秀心理健康教育中心”；2008年，更名“心理健康教育中心”，获评“全国先进单位”；2013年，获批“湖北省首批心理健康教育示范中心”立项建设；2014年，更名“长江大学学生心理健康教育中心”，升格为副处级单位；2016年，中心通过验收成为了“湖北省首批心理健康教育示范中心”。目前，中心设有“心理咨询”和“教育培训”两个科室，共有专职工作人员9人。
长江大学学生心理健康教育中心始终以“育心育人”为工作理念，将“宣传普及转观念，咨询服务助成长，教育培训促发展，危机干预保平安”作为基本工作思路，致力于开展“预防心理危机、优化心理品质、促进人格健全”的学生心理健康教育工作，充分发挥心理健康在学生思想政治教育工作中的积极作用，形成了符合长大校情、具有长大特色的工作模式，产生良好社会影响，赢得师生普遍赞誉。
2018年10月，“荆州市校外未成年人心理健康辅导中心”正式在长江大学学生心理健康教育中心挂牌成立。“荆州市校外未成年人心理健康辅导中心”是在市文明办和市教育局的领导下，以长江大学学生心理健康教育中心为依托，校地合作共建，服务于全市未成年人心理健康的公益性组织。中心设在长江大学东校区学生工作部（处），借助该校学生心理健康教育中心的“心理学专业师资队伍”和“学生朋辈心理志愿者组织”，通过联动荆州市各直属学校的辅导站，面向全市学生、家长和教师，全方位开展个体、团体心理健康教育，家庭教育指导和教师专业提升培训，以促进未成年人的身心健康发展。
